I molekylærbiologi er STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) en biologisk database og webressource med kendte og forudsagte protein-protein-interaktioner. … Den seneste version 11b indeholder oplysninger om omkring 24,5 millioner proteiner fra mere end 5000 organismer.
Hvad er formålet med STRING-databasen?
STRING-databasen sigter på at indsamle og integrere denne information ved at konsolidere kendte og forudsagte protein–proteinassocieringsdata for et stort antal organismer.
Hvad er en STRING-score?
I STRING er hver protein-protein-interaktion annoteret med en eller flere 'scores'. Det er vigtigt, at disse scores ikke indikerer styrken eller specificiteten af interaktionen. I stedet er de -indikatorer for tillid, dvs. hvor sandsynligt STRING vurderer, at en interaktion er sand, givet de tilgængelige beviser.
Hvorfor interagerer proteiner?
Protein–protein-interaktioner (PPI'er) er fysiske kontakter med høj specificitet etableret mellem to eller flere proteinmolekyler som et resultat af biokemiske hændelser styret af interaktioner, der inkluderer elektrostatiske kræfter, brint binding og den hydrofobe effekt.
Hvad er funktionel tilknytning?
definition. Binært forhold mellem biologiske enheder når en af dem modulerer den anden med hensyn til funktion, udtryk, nedbrydning eller stabilitet af den anden og forholdetmellem partnerne kan ikke fastslås som direkte, så mellemliggende trin er implicit til stede.
