I modsætning hertil falder de fleste eukaryote DNA-ligaser sammen med arkæale og bakteriofagenzymer i den anden underfamilie; disse enzymer anvender ATP som en cofaktor.
Kræver ligaser ATP?
To DNA-ligaser er almindeligt anvendt. … T4-ligase kræver ATP , mens E. coli-ligase kræver NAD+ (Nicotinamid-adenindinukleotid er et coenzym, der består af 2 nt forbundet gennem deres fosfatgrupper). Begge katalyserer sammenføjningen af en 5'-phosphat- og en 3'-OH-gruppe for at danne en phosphodiesterbinding.
Hvorfor har ligaser brug for ATP?
De to trin af DNA-ligeringsreaktionen
DNA-ligeringsreaktionen i sig selv har to grundlæggende trin. For det første skal DNA-enderne støde sammen ved et tilfælde og forblive sammen længe nok til, at ligasen kan slutte sig til dem. … For at tillade enzymet at udføre yderligere reaktioner skal AMP i enzymets aktive sted genopfyldes med ATP.
Hvad er ligasernes funktion?
DNA-ligaser spiller en væsentlig rolle i vedligeholdelse af genomisk integritet ved at forbinde brud i phosphodiester-rygraden af DNA, der opstår under replikation og rekombination, og som en konsekvens af DNA-skade og dets reparation. Tre humane gener, LIG1, LIG3 og LIG4 koder for ATP-afhængige DNA-ligaser.
Hvad er ligaser fungerer de aktivt eller passivt?
DNA-ligase er aktiv under replikationen, reparations- og rekombinationsprocessen af DNA. Det anvendes i vid udstrækning til reparation af enkeltstrengetbrud i dupleks-DNA fra levende organismer ved at bruge den komplementære streng af dobbelthelixen som skabelon, mens nogle former specifikt kan reparere dobbeltstrengsskader.
