Agarosegeler bruges sammen med DNA på grund af biomolekylernes større størrelse (DNA-fragmenter er ofte tusindvis af kDa). For proteingeler giver polyakrylamid god opløsning, da den langt mindre størrelse (50 kDa er typisk) er mere velegnet til de snævrere intermolekylære mellemrum i gelen.
Hvad er forskellen mellem agarosegelelektroforese og polyacrylamidgelelektroforese?
Den største forskel mellem agarose og polyacrylamid er, at agarose bruges i agarosegelelektroforese (AGE) hovedsageligt til adskillelse af DNA, hvorimod polyacrylamid bruges i polyacrylamidgelen elektroforese (PAGE) hovedsageligt til adskillelse af proteiner.
Hvorfor er polyacrylamidgeler bedre end agarosegel?
Polyacrylamidgeler har følgende tre store fordele i forhold til agarosegeler: (1) Deres opløsningsevne er så stor, at de kan adskille DNA-molekyler, hvis længder afviger med så lidt som 0,1 % (dvs. 1 bp i 1000 bp.). (2) De kan rumme meget større mængder DNA end agarosegeler.
Hvorfor bruges polyacrylamid i stedet for agarose ved karakterisering af proteiner?
Polyacrylamid og agarose er to støttematricer, der almindeligvis anvendes i elektroforese. … Agarose har en stor porestørrelse og er egnet til at adskille nukleinsyrer og store proteinkomplekser. Polyakrylamid har en mindre porestørrelse og er ideel tiladskiller størstedelen af proteiner og mindre nukleinsyrer.
Hvorfor bruges polyakrylamidgel?
Polyacrylamidgelelektroforese (PAGE) bruges rutinemæssigt til proteinanalyse og kan også bruges til at adskille nukleinsyrefragmenter mindre end 100 bp. Nukleinsyrer analyseres sædvanligvis ved hjælp af et kontinuerligt buffersystem, hvor der er en konstant buffersammensætning, pH og porestørrelse i hele gelen.