BLAST kan bruges til flere formål. Disse omfatter identifikation af arter, lokalisering af domæner, etablering af fylogeni, DNA-kortlægning og sammenligning. Med brugen af BLAST kan du muligvis korrekt identificere en art eller finde homologe arter.
Hvad bruges BLAST til?
BLAST er en computeralgoritme, der er tilgængelig til brug online på webstedet National Center for Biotechnology Information (NCBI), såvel som mange andre websteder. BLAST kan hurtigt justere og sammenligne en forespørgsels-DNA-sekvens med en database med sekvenser, hvilket gør den til et kritisk værktøj i igangværende genomisk forskning.
Hvad er BLAST-teknik?
BLAST-teknikken er en klageløsningsmetode udviklet af Albert Barneto . Mnemonikken står for Tro, Lyt, Undskyld, Tilfreds og Tak (Tabel 1). 6. Denne artikel beskriver dens anvendelighed i patientbehandling og som et klinisk undervisningsværktøj.
Hvordan virker BLAST DNA?
Hvordan virker BLAST? BLAST identificerer homologe sekvenser ved hjælp af en heuristisk metode, som indledningsvis finder korte overensstemmelser mellem to sekvenser; således tager metoden ikke hele sekvensrummet i betragtning. Efter den indledende kamp forsøger BLAST at starte lokale justeringer fra disse indledende kampe.
Hvorfor er BLAST hurtigere end Fasta?
Med hensyn til algoritmernes runtime-kompleksitet er BLAST hurtigere end FASTA ved kun at søge efter de mere signifikante mønstre isekvenser. Følsomheden (eller nøjagtigheden) af BLAST og FASTA har tendens til at være forskellig for nukleinsyre- og proteinsekvenser (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
