Hvor findes DNase I-overfølsomhedssteder, og hvad indikerer de om kromatins natur? Disse steder findes ved exon-intron-forbindelserne og angiver stedet for mRNA-sp altning under splejsning. Disse steder findes tilfældigt i hele genomet, og det gør DNA sårbart over for nedbrydning.
Hvad er et DNase I-overfølsomt sted, og hvordan påvirker det kromatin?
I genetik er DNase I hypersensitive sites (DHS'er) regioner af kromatin, der er følsomme over for sp altning af DNase I-enzymet. I disse specifikke områder af genomet har kromatin mistet sin fortættede struktur, blotlagt DNA'et og gjort det tilgængeligt.
Hvad foreslår et DNase-overfølsomt websted?
Aktive cis-regulatoriske elementer er overfølsomme over for sp altning af endonukleasen DNase I. Motiver inden for DNase I hypersensitive steder indikerer potentiel trans-agerende faktor belægning og, når de kombineres med DNase I sp altningsdata, kan bruges til at konstruere foreløbige regulatoriske netværk.
Hvad er DNase-overfølsomhedsanalyse?
I mere end to årtier har DNase I-hypersensitivitetsanalysen (DHA) været instrumental til at opdage regulatoriske domæner (11). Denne metode kortlægger diskrete steder i genomet, hvor konformationen af kromatin gør dets DNA overfølsomt over for sp altning af endonukleasen DNase I (12).
Hvad er et nuklease-overfølsomt sted i kromatin?
Indkromatin, nukleosomfrie regioner kendt som nuklease-overfølsomme steder menes at repræsentere de "åbne vinduer", der tillader øget adgang af afgørende residente cis-virkende DNA-sekvenser til trans-virkende faktorer (se ref..